1979年，昆侖山發(fā)生神秘生物骸骨，由胡八一（趙又廷飾）率領(lǐng)的探險(xiǎn)隊(duì)深入昆侖山腹地，尋找有關(guān)古生物遺跡的更多秘密，卻不料在這個(gè)過程中遭到不同神秘生物的輪番攻擊，并意外墜入九層妖塔，除胡八一外，一行人生死成謎。胡八一退伍后回到北京，重逢了發(fā)小王凱旋（馮粒飾），并在神秘人（李晨飾）與科考隊(duì)（鳳小岳、唐嫣、李光潔飾）兩股力量的夾縫中重新踏上了探尋未知文明的征程，途中與Shirley楊（姚晨飾）邂逅，熟識的面孔喚醒了他身處探險(xiǎn)隊(duì)那段日子的記憶。此行兇險(xiǎn)，在還沒來得及搞清楚Shirley的真實(shí)身份之際，胡八一、Shirley、王胖子率領(lǐng)一行人便在王子墓、石油小鎮(zhèn)等地遭到不明生物的轟炸，這里所發(fā)生的一切再度指向九層妖塔，而這次等待他們的，將是一個(gè)塵封已千年的未解之謎……