分隔在兩個(gè)世界的愛(ài)力克兄弟二人，使用各自的手段嘗試著兄弟再會(huì)。哥哥愛(ài)德華穿過(guò)“門”來(lái)到真實(shí)世界。公元1923年的德國(guó)慕尼黑，一場(chǎng)世界大戰(zhàn)即將到來(lái)。無(wú)法在這個(gè)世界使用煉金術(shù)的愛(ài)德華，與長(zhǎng)相酷似弟弟的青年愛(ài)爾凡斯一起研究火箭的科技，希望借助火箭回到原來(lái)的世界。另一邊的煉金術(shù)世界，弟弟阿爾馮斯修行煉金術(shù)，打扮宛若曾經(jīng)的愛(ài)德華，與國(guó)家煉金術(shù)士們一起尋找找回哥哥的方法。而暗地中，慕尼黑的一個(gè)神秘組織開始了尋找理想國(guó)“香巴拉”的儀式，連接煉金術(shù)世界與現(xiàn)實(shí)世界的“門”被打開了。兄弟二人的命運(yùn)與兩個(gè)世界的危機(jī)交織在一起，愛(ài)力克兄弟要面對(duì)前所未有的挑戰(zhàn)。