100年前，沙漠之都迪塞爾市因?yàn)閷毧蓧糁g的戰(zhàn)斗而遭受嚴(yán)重破壞。那場戰(zhàn)斗的起因是由于一只精靈寶可夢的存在。但是，這只精靈寶可夢后來被某人封印了，現(xiàn)在的城市也找回了曾經(jīng)的平靜在小智與皮卡丘一行人的旅途中，他們遇到了持有可以召喚萬事萬物的光輪的幻之精靈寶可夢胡帕，以及照顧它的少女麥雅麗。喜歡惡作劇的胡帕用那個(gè)不可思議的圓環(huán)取出最喜歡的甜甜圈以及各種東西讓大家大吃一驚，并且樂在其中。天真無邪的胡帕稱呼小智和皮卡丘為小~智智和皮~卡卡。完全成為好友的胡帕與小智一行人一起踏上旅途。一到迪塞爾市，眾人就遇到了麥雅麗的哥哥巴爾扎，但是巴爾扎的樣子卻很奇怪。仔細(xì)一看，發(fā)現(xiàn)他手中握有封印了曾經(jīng)破壞城市的某只精靈寶可夢的道具監(jiān)獄之瓶！一股邪惡的氣息從瓶中溢出，成為一個(gè)巨大的影子。影子逐漸展現(xiàn)的真身，那便是胡帕原本被分離的姿態(tài)超胡帕！無論如何也想不到，100年前發(fā)生暴動(dòng)的寶可夢的元兇正是超胡帕。瓶中封印的是胡帕原本的力量，那個(gè)強(qiáng)大的力量在漫長的歲月里，逐漸變?yōu)閼嵟?，最終凝結(jié)成為黑影以超胡帕的形態(tài)復(fù)蘇！被解放的超胡帕開始暴走，從6個(gè)圓環(huán)里召集傳說中精靈寶可夢：原始古拉頓、原始蓋歐卡、迪奧魯加、帕魯基亞、基拉帝納還有丘雷姆！再這樣下去，城市危在旦夕胡帕為了守護(hù)城市，用圓環(huán)邀請新的傳說中的精靈寶可夢！名副其實(shí)的【傳說vs傳說】！這場戰(zhàn)斗使得大地開裂、大海分離、空間也變得扭曲！小智一行人與胡帕邀請來的傳說精靈寶可夢一同作戰(zhàn)，他們能夠守護(hù)這個(gè)迪塞爾市嗎?。窟€有，胡帕與超胡帕的戰(zhàn)斗將如何收場！？精靈寶可夢電影史上最壯烈的對決將在此展開！
